Genetic inferences about paternity in the Paisa community from Antioquia, Colombia

Abstract

ABSTRACT: This paper compiles gene frequencies of classical, and DNA genetic markers in order to solve the power of non exclusion paternity for the Antioquian community in Colombia. Two ways of quantifying the rarity of non-exclusion of paternity were used. The first way was the Bayesian approach that compute a likelihood ratio of the trio with the putative father as real father versus the trio with the real father as a random male. This likelihood ratio or paternity index can be transformed into a posterior probability if a prior probability of paternity is supplied. The other approach was that of the computation of the probability that a random male would not be excluded by at least one of the tests given the phenotypes of the mother and child. In this case, we carried out the estimation of the paternity index and of the non exclusion probability. Both of these measures are computed for each locus separately and cumulated over all loci. All analyses are exemplified by using a real example. Finally, we estimated the paternity exclusion probability by using the Ohno et al. equation for each locus with alleles.

RESUMEN: Este artículo compila información sobre la distribución de las frecuencias genéticas de marcadores genéticos clásicos y de DNA con la finalidad de observar el comportamiento del parámetro de no-exclusión en disputas de paternidad originadas en individuos que pertenecen al departamento de Antioquia, Colombia. Primero usamos la aproximación Bayesiana, que computa la probabilidad del trío en problema tomando al padre real como el padre putativo, comparada contra la probabilidad de un trío con un padre aleatorio tomado de la población problema. Esta razón de verosimilitud o índice de paternidad puede ser transformada en una probabilidad posterior si una probabilidad a priori de paternidad es entregada. La otra aproximación que usamos fue el cómputo de la probabilidad de que un hombre aleatorio no sea excluido por al menos una de las pruebas biológicas realizadas teniendo como condición los fenotipos de la madre y el niño. En este caso, estimamos el índice de paternidad y la probabilidad de no-exclusión. Todos los parámetros fueron estimados para cada locus y acumulados sobre todos los loci. Se usó un ejemplo real como aproximación práctica. Finalmente estimamos el poder de exclusión de la paternidad de acuerdo con la ecuación de Ohno et al. para cada locus con n alelos.