Estudios moleculares en algunos genes candidatos a inmunodeficiencias primarias en 4 pacientes del área asistencial del grupo inmunodeficiencias primarias de la Universidad de Antioquia

Abstract

RESUMEN: Las inmunodeficiencias primarias (IDP) son enfermedades raras ocasionadas por defectos genéticos y/o hereditarios en moléculas involucradas en la respuesta inmune. Actualmente estas enfermedades se dividen en 9 subgrupos, dentro de las cuales se encuentran las deficiencias predominantemente de anticuerpos y las deficiencias del complemento. Dentro de las deficiencias predominantemente de anticuerpos se encuentra la Inmunodeficiencia Común Variable (ICV), la cual es una de las IDPs más frecuentes y más del 90% de los pacientes no tienen un diagnóstico molecular definido. También se encuentran las deficiencias del complemento dentro de las cuales se encuentra la Deficiencia de C3, la segunda mayormente reportada según LASID. La caracterización genética de estas enfermedades es muy importante, para realizar consejería genética y proponer terapias más específicas. En el presente trabajo se realizó un análisis de secuenciación del exoma en cuatro pacientes (3 de ellos con diagnóstico de ICV y 1 con deficiencia del complemento), se identificaron cuatro variantes en 4 genes priorizados (TNFRSF9, A2M, TCF3 y C3) y posteriormente se realizó una confirmación de las mutaciones encontradas. A uno de los pacientes se le realizó la medición de alfa 2-macroglobulina y se encontraba disminuida, lo cual indica que la mutación en este gen posiblemente influya en la producción de la proteína. Al paciente donde se le encontró la variante en el gen TCF3, se le realizó también un modelamiento de su proteína, pero ésta no fue concluyente, ya que según el gráfico de Ramachandran la mayoría de los residuos de aminoácidos no se encontraban en la zona favorable y por lo tanto la estructura secundaria de la proteína podría ser errada. Se encontró además una disminución en la proteína C3 en el paciente con mutaciones en este gen, entonces se realizó pruebas funcionales de complemento al paciente, en el cual se identificó que no tenía la proteína. Para concluir, el presente trabajo identifica 3 nuevas variantes en los genes mencionados anteriormente y que pueden influir directamente en la producción de cada una de las proteínas que codifican. Se necesitan más estudios posteriores que realicen procedimientos para analizar funcionalmente cada una de esas proteínas.

ABSTRACT: Primary immunodeficiencies (PID) are rare diseases caused by genetic and/or hereditary defects in molecules involved in the immune response. Currently these diseases are divided into 9 subgroups, among which are predominantly antibody deficiencies and complement deficiencies. Among the predominantly antibody deficiencies is Common Variable Immunodeficiency (CVID), which is one of the most frequent PIDS and more than 90% of patients do not have a defined molecular diagnosis. Complement deficiencies are also found within which the C3 deficiency is found, the second mostly reported, according to LASID.The genetic characterization of these diseases is very important, to perform genetic counseling and propose more specific therapies. In the present work, exome sequencing analysis was performed for 4 patients (3 of them with diagnosis of CVID and 1 with complement's deficiency) and 4 variants were identified in 4 prioritized genes (TNFRSF9, A2M, TCF3 and C3). One of the patients underwent the measurement of A2M and it was diminished, which indicates that the mutation possibly influences the production of the protein. The protein variant in TCF3 gene was also modeled, but this was not conclusive, since according to the Ramachandran graph, most of the amino acid residues were not in the favorable zone and therefore the secondary structure of the protein might be not accurate. A decrease in the C3 protein was also found, then a complement test was performed on the patient, in which it was identified that it did not have the protein. To conclude, the present work identifies 3 new variants in the genes mentioned above that can directly influence the production of each of the proteins they encode. Further studies are needed to perform procedures to functionally analyze each of these proteins.