Análisis de ligamiento de esquizofrenia con genes del neurodesarrollo mediante cinco marcadores microsatélites

Abstract

RESUMEN: Introducción. El objetivo fue evaluar el efecto que posibles variantes en genes del neurodesarrollo tienen sobre la susceptibilidad a la esquizofrenia en dos familias colombianas. Métodos. En dos familias con varios afectados por esquizofrenia según DSM-IV, se depuró el fenotipo con la entrevista diagnóstica para estudios genéticos (DIGS) y el procedimiento de “mejor estimación diagnóstica”. Se evaluó el poder de ligamiento en las familias mediante análisis de simulación con el programa SLINK y se hizo análisis de ligamient paramétrico y no-paramétrico con marcadores microsatélites D7S2504 situado en el gen RELN, D6S2414 y D6S1014 cercanos al gen NOTCH4 y D1S1653 y D1S1679. Resultados. Con la simulación se obtuvo un lod score máximo de 1.33 para las dos familias cuando se consideró el fenotipo de forma estrecha con patrón de herencia autosóm corecesivo. El lod score máximo obtenido con el análisis de ligamiento fue 0.18 para el marcador D7S2504 (situado en el gen de la relina) con patrón de herencia autosómico recesivo, con penetrancia incompleta y al considerar el fenotipo amplio. Para este mismo marcador y con fenotipo amplio, se obtuvo el valor más ajo de p(p=0.4) en el análisis no paramétrico, correspondiente a un NPL de pares de 0.03. Conclusión. En estas familias no fue posible confirmar ni descartar ligamiento entre la esquizofrenia y los marcadores D1S1653, D1S1679, D6S2414, D6S1014 y D7S2504 con el análisis paramétrico y no paramétrico, ya que no se encontraron lod score menores de –2.

ABSTRACT: Introduction. The goal was to evaluate the effect that possible variants in neurodevelopmental genes have on the susceptibility to schizophrenia in two Colombian families. Methodology. In two families with more than two affected members with schizophrenia using DSM-IV criteria, the phenotype was defined with the Diagnostic Interview for Genetic Studies (DIGS), and the Best Estimate procedure. The linkage power was evaluated in the families through simulation analysis with the SLINK software and a parametric and nonparametric linkage analysis was made with the micro-satelite markers D7S2504 situated at the RELN gene, the D6S2414 and D6S1014 near the NOTCH4 gene, and D1S1653 and D1S1679. Results. A maximum lod score of 1.33 was obtained for both families with the simulation when the phenotype was considered in a very strict form and using an autosomic recesive inheritance patron. The maximum obtained lod score with the linkage analysis was 0.18 for the D7S2504 marker (located at the reelin gene) with a recesive autosomic inheritance patron, an incomplete penetrance and considering a broader phenotype. For this marker and with a broader phenotype, a lower p value (p=0.4) was obtained in the non-parametric analysis, corresponding to a NPL of 0.03. Conclusion. In these families it was not possible to discard linkage between schi-zophrenia and the D1S1653, D1S1679, D6S2414, D6S1014 and D7S2504 markers with the parametric and non parametric analysis, because no lod score values lower than –2 were found.