Detección, caracterización genómica y frecuencia de circovirus canino en perros con y sin síndrome diarreico en Medellín

Abstract

RESUMEN: Circovirus canino (CanineCV), es un agente emergente, descrito por primera vez en el año 2011 en Estados Unidos. Pertenece a la familia Circoviridae, cuenta con un genoma monocatenario covalentemente cerrado de 2063 nt, siendo ambisentido con dos ORF principales dispuestos en forma inversa. CanineCV infecta cánidos silvestres (zorros, lobos, tejones) y domésticos, la infección es asociada a cuadros clínicos de gastroenteritis aguda, diarrea hemorrágica, signos de vasculitis, linfadenitis, trombocitopenia, neutropenia y linfopenia, lo que se relaciona con actividad inmunosupresora por daño del tejido linfoide, lo cual se ha descrito en infección por Circovirus en aves y cerdos. Sin embargo, el virus también ha sido detectado en muestras de caninos asintomáticos, por lo que su patogenia y epidemiología no se pueden definir aún con claridad. CanineCV se define como un agente de distribución mundial ya que su circulación se ha reportado en 4 de 5 continentes. Los análisis filogenéticos de las cepas reportadas han permitido clasificar las secuencias en diferentes clados, cuya agrupación depende principalmente de la ubicación geográfica en donde fue encontrada cada secuencia. Sin embargo, cuando se realiza su detección y caracterización genómica en nuevos lugares se presentan diferencias en las agrupaciones ya descritas, en especial cuando se realiza con secuencias de mayor ancestralidad. La prevalencia de CanineCV en diferentes países, tanto en muestras de pacientes con signos compatibles como de animales asintomáticos es variable, con valores que oscilan entre el 1-30%, reportándose en la mayoría de los casos en coinfección con otros agentes infecciosos donde se destaca Parvovirus canino tipo 2 (CPV-2), alcanzando tasas de coinfección de hasta un 100%. Lo que sugieren las investigaciones actuales es que su rol como patógeno puede ser el exacerbar cuadros clínicos, como se ha descrito en la infección por Circovirus porcino (PCV) en cerdos, debilitando el sistema inmune y favoreciendo la entrada y diseminación de otros virus y bacterias, no obstante, su participación como agente coinfectante aún no es precisa. En Colombia se confirmó la circulación de CanineCV en el año 2020, a partir de muestras positivas a CPV-2, el estudio realizado concluyó la necesidad de aumentar la vigilancia CanineCV en poblaciones domésticas para comprender mejor su rol en enfermedades entéricas en caninos, su papel en animales asintomáticos o en coinfección con otros patógenos, y la frecuencia del virus en distintas regiones del país, con el fin de vislumbrar el comportamiento epidemiológico de la infección. Dado este contexto, el presente trabajo pretende determinar la frecuencia, y caracterización genómica de Circovirus canino y su coinfección con parvovirus en una región de Colombia, específicamente la ciudad de Medellín, con un mayor número de muestras de materia fecal examinadas y partiendo de animales que presentaron diarrea sin un diagnóstico establecido e incluyendo además un grupo de animales clínicamente sanos. Posterior a la recolección de muestras, se realizó la detección de CanineCV y CPV-2 mediante PCR convencional, obteniendo veintiséis muestras positivas para CanineCV, tres para CPV-2 y cero coinfecciones, la mayor frecuencia de CanineCV se encontró en el grupo de caninos con diarrea, respecto al sexo, fue más frecuente en machos, y en relación con la edad en cachorros de menos de un año, además el 60,6% de los positivos presentaba el plan vacunal vigente. El análisis filogenético evidencio la separación en diferentes clados del virus y la filogeografía un origen chino procedente de perros domésticos. El presente trabajo, evidencia que la frecuencia de CanineCV es elevada en animales con diarrea respecto a lo que se esperaba, sin requerir la coinfección con CPV-2, lo que expone el sub-diagnóstico que existe del virus. Por otra parte, los análisis filogenéticos mostrados aquí, resaltan la necesidad de realizar evaluaciones en especies silvestres y en otras regiones de Colombia, resaltando además la importancia de continuar los estudios e investigaciones en CanineCV ya que aún existen vacíos de conocimiento que impiden determinar la relación verdadera que puede tener este virus en las infecciones gastroentéricas en caninos tanto domésticos como silvestres.