Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem: https://hdl.handle.net/10495/14529
Título : Diversidad genética de Plasmodium falciparum y presentación clínica de la infección en tres regiones endémicas de Colombia
Autor : Pérez Pérez, Juan Camilo
metadata.dc.contributor.advisor: Tobón Castaño, Alberto
metadata.dc.subject.*: Variación Genética
Genetic Variation
Plasmodium falciparum
Proteína 1 de Superficie de Merozoito
Merozoite Surface Protein 1
Diversidad genetica
Turbo (Antioquia)
El Bagre (Antioquia)
Tumaco (Nariño)
Fecha de publicación : 2020
Resumen : RESUMEN: Introducción: En Latinoamérica la diversidad genética de P. falciparum ha mostrado ser reducida. La mayoría de investigaciones realizadas en Colombia informan la diversidad genética por frecuencias de familias alélicas y muestran un panorama limitado estudiando genes codificantes para las Proteínas 1 y 2 de Superficie del Merozoíto -MSP1-(familia-MAD20) y -MSP2-(familia-3D7), las cuales han mostrado frecuencias mayores al 80% sin relacionarlo, por ejemplo, con la patogenicidad del parásito. Este estudio caracterizó la diversidad genética de P. falciparum empleando MSP1, MSP2, GLURP y PfEMP1 y su relación con la presentación clínica de la enfermedad en residentes de tres regiones endémicas de Colombia. Metodología: Es un estudio descriptivo transversal, realizado en Turbo y El Bagre (Antioquia) y Tumaco (Nariño). Los participantes tenían infección única por P. falciparum diagnosticada por gota gruesa y nPCR; se clasificaron por perfil clínico (sintomático-asintomático). En las muestras se realizó PCR y secuenciación para los genes msp1, msp2, glurp y var, éstos últimos codifican para la Proteína Rica en Glutamato y la Proteína de Superficie Eritrocitaria-1 respectivamente. Se determinaron frecuencias alélicas, número de haplotipos, heterocigocidad y diversidad nucleotídica. Finalmente, se compararon con los diferentes perfiles clínicos mediante análisis de distancias p y el índice de fijación (Fst). Resultados: Se incluyeron 143 participantes, 77(53,8%) de Tumaco, 20(14,0%) de El Bagre, y 46(32,2%) de Turbo; 25 participantes positivos (17,5%) eran asintomáticos. La frecuencia de bandas ausentes, bandas únicas y múltiples para cada marcador fue respectivamente: 1) MSP1: 11 (7,7%), 103 (72,0%) y 29 (20.3%); 2) MSP2: 11 (7,7%), 128 (89,5%) y 4 (2,8%); 3) GLURP: 16 (11,2%), 110(76,9%), 17(11,9%); y4) VAR 18(12,6%), 125(87,4%) y para este marcador no se hallaron bandas múltiples. Los participantes asintomáticos presentaron bandas múltiples únicamente en MSP1 (12%). El cual fue menor comparado con los sintomáticos (22%). Se encontró diferenciación genética para todos los marcadores individuales y concatenados cuando se compararon los años de muestreo (2018-2016 y 2006). El municipio más diverso para todos los marcadores fue Tumaco el cual también se diferenció de los municipios de Antioquia. El Bagre fue el l menos diverso. Los participantes asintomáticos mostraron un menor número de haplotipos y diversidad genética, además, tuvieron diferenciación genética significativa para MSP1 (Fst=0,13) y MSP2 (Fst=0,15) en comparación con los sintomáticos. Conclusiones: Se observó una mayor proporción de infecciones con bandas únicas; MSP1 presentó la mayor frecuencia de bandas múltiples. Las infecciones asintomáticas se caracterizaron por tener bandas únicas, excepto para el marcador MSP1 con bandas múltiples, pero con menor frecuencia que en sintomáticos. Las poblaciones por periodo de tiempo fueron significativamente diferentes. La presentación sintomática fue en general mucho más diversa que la población asintomática. Sin embargo, es necesario complementar con estudios con un mayor número de participantes asintomáticos para tener una mejor representatividad.
ABSTRACT: Introduction: In Latin America the genetic diversity of P. falciparum has been shown to be reduced; The majority of researches carried out in Colombia report genetic diversity by frequencies of allelic families and show a limited panorama studying genes coding for Merozoite Surface Proteins 1 and 2 -MSP1- (family-MAD20) and - MSP2- (family-3D7 ), which have shown frequencies greater than 80%. This study characterized the genetic diversity of P. falciparum using MSP1, MSP2, GLURP (Protein Rich in Glutamate) and EMP1 (Erythrocyte Surface Protein-1 -PfEMP1-) and its relationship with the clinical presentation of the disease in residents of three endemic regions of Colombia. Methodology: A cross-sectional descriptive study, carried out in Turbo and El Bagre (Antioquia) and Tumaco (Nariño) municipalities. The participants had P. falciparum infection diagnosed by thick blood smear and nPCR; were classified by clinical profile (symptomatic-asymptomatic). PCR and sequencing were performed for the msp1, msp2, glurp and var genes, the latter encoding for PfEMP1). Allelic frequencies, number of haplotypes, heterozygosity and nucleotide diversity were determined. Finally, they were compared with the different clinical profiles by analysis of distances p and the fixation index (Fst). Results: 143 participants were included, 77 (53.8%) from Tumaco, 20 (14.0%) from El Bagre, and 46 (32.2%) from Turbo; 25 participants (17.5%) were asymptomatic. The frequency of absent bands, single or multiple bands for each marker were: 1) MSP1: 11 (7.7%), 103 (72.0%), 29 (20.3%); 2) MSP2: 11 (7.7%), 128 (89.5%), 4 (2.8%); 3) GLURP: 16 (11.2%), 110 (76.9%), 17 (11.9%); 4) VAR 18 (12.6%), 125 (87.4%), no multiple bands were found. Asymptomatic participants presented multiple bands only in MSP1 (12%), being smaller than in symptomatic participants (22%). Genetic differentiation was found for all markers and when concatenating when comparing the sampling years (2016-2018 and 2006). The most diverse municipality for all markers was Tumaco which differed from the municipalities of Antioquia and the least diverse was El Bagre. Asymptomatic participants showed a lower number of haplotypes and genetic diversity, in addition significant genetic differentiation was shown using MSP1 (Fst =0.13) and MSP2 (Fst = 0.15) compared with the symptomatic. Conclusions: A higher proportion of infections with single bands was observed; MSP1 presented the highest frequency of multiple bands. Asymptomatic infections were characterized by having single bands, except for the MSP1 marker with multiple bands but less frequently than in symptomatic ones. The populations by time period were significantly different. The symptomatic presentation was generally much more diverse than the asymptomatic population, however it is necessary to complement studies with a greater number of asymptomatic participants in order to in order to broaden these findings.
Aparece en las colecciones: Maestrías de la Corporación Académica Ciencias Básicas Biomédicas

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