Complex segregation analysis of nonsyndromic Cleft Lip/Palate in Antioquia, Colombia

Abstract

ABSTRACT: The present study was undertaken to examine the pattern of inheritance of Ceft Lip/Palate (CLP) in pedigrees ascertained from Antioquia, Colombia. Ninety-five extended and multigenerational pedigrees, constituted by 201 nuclear components and 1.136 records were analyzed. Ten hypothetical models were contrasted using likelihood ratio tests. The hypotheses of no familial transmission, multifactorial component compared against that of the existence of a major gene only, the existence of a recessive major gene, that of non major component in the mixed model and that of the non transmission of major effect (t1 = 12 = (3) were rejected. In contrast. hypotheses postulating a major locus (dominant, codominant) and that of no polygenic component in the mixed model could not be rejected. Iteration of the parameter 12 was the most parsimonious. Thus far, the most parsimonious model is that of a major gene (dominant-codominant) without multifactorial effects but, taking into account, that the (2 iteration in the major gene model with unrestricted d. result in a significantly improving of the model likelihood, oligogenic interactions can not be underrated.

RESUMEN: El presente estudio fue realizado para evaluar el patrón hereditario de Labio/Paladar Hendido (CLP) en genealogías estudiadas en el departamento de Antioquia, Colombia. Se analizaron 95 genealogías multigeneracionales extendidas. constituidas por 201 componentes nucleares y 1.136 individuos. Se contrastaron diez modelos hipotéticos mediante el test de verosimilitud. Las hipótesis de no-transmisión familiar y el componente multifactorial, comparadas contra la hipótesis de existencia de un gen mayor y de un gen mayor recesivo, y la no existencia del componente mayor en el modelo mixto y no transmisión de efectos mayores (11-12-13), fueron refutadas. En contraste, no pudieron refutarse las hipótesis que postulan un locus mayor (dominante, codominante) y un componente no poligénico en el modelo mixto. El modelo más parsimonioso fue el de gen mayor (dominante-codominante) sin efectos multifactoriales tomando en cuenta la iteración del parámetro 12 con d no restringido, lo que resultó en un mejoramiento significativo del valor de verosimilitud en este modelo. Las interacciones oligogénicas no pueden ser subestimadas.