Caracterización de la variabilidad genética de cepas de campo de Brucella canis aisladas en Antioquia

Abstract

RESUMEN: Brucella canis, un patógeno intracelular facultativo, es responsable de la brucelosis canina, una enfermedad zoonótica que afecta a los caninos y al hombre. En los primeros causa abortos y fallas reproductivas; en el ser humano genera síntomas inespecíficos. En el ano ̃ 2005 se demostró la presencia de B. canis en Antioquia (Colombia). Las cepas halladas se identificaron como tipo 2. La secuenciación del genoma completo de una cepa de campo denominada Brucella canis str. Oliveri mostró indels específicos de especie; a partir de estos se buscó conocer características genómicas de las cepas de B. canis aisladas y establecer relaciones filogenéticas, así como el tiempo de divergencia de la cepa Oliveri. Se realizó PCR convencional y secuenciación de 30 cepas de campo, se identificaron 5 indels reconocidos en B. canis str. Oliveri, se empleó ADN de Brucella suis, Brucella melitensis y cepas vacunales de Brucella abortus como controles. Se determinó que las cepas de campo estudiadas comparten 4 de los 5 indels de la cepa Oliveri, lo que indica la presencia de más de una cepa de B. canis circulando en la región. El análisis filogenético se realizó con 24 cepas de Brucella mediante secuencias concatenadas de genes marcadores de especie. Se probó la hipótesis del reloj molecular y adicionalmente se realizó test de tasas relativas de Tajima. De esta manera se demostró que la cepa Oliveri, al igual que las otras cepas de B. canis analizadas, divergen de B. suis. Se rechazó la hipótesis del reloj molecular entre las especies de Brucella y se demostró una tasa de evolución y una distancia genética similar entre las cepas de B. canis.

ABSTRACT: Brucella canis is a facultative intracellular pathogen responsible for canine brucellosis, a zoonotic disease that affects canines, causing abortions and reproductive failure; and the production of non-specific symptoms in humans. In 2005 the presence of B. canis in Antioquia was demonstrated and the strains were identified as type 2. The sequencing of the genome of a field strain denoted Brucella canis str. Oliveri, showed species-specific indel events, which led us to investigate the genomic characteristics of the B. canis strain isolated and to establish the phylogenetic relationships and the divergence time of B. canis str. Oliveri. Conventional PCR sequencing was performed in 30 field strains identifying 5 indel events recognized in B. canis str. Oliveri. ADN from Brucella suis, Brucella melitensis and vaccine strains from Brucella abortus were used as control, and it was determined that all of the studied field strains shared 4 out of the 5 indels of the sequenced Oliveri strain, indicating the presence of more than one strain circulating in the region. Phylogenetic analysis was performed with 24 strains of Brucella using concatenated sequences of genetic markers for species differentiation. The molecular clock hypothesis and Tajima’s relative rate test were tested, showing that the Oliveri strain, similarly to other canis species, diverged from B. suis. The molecular clock hypothesis between Brucella species was rejected and an evolution rate and a similar genetic distance between the B. canis were demonstrated.