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| Fecha de publicación | Título | Autor(es) |
| 2004 | Altitudinal Variation of the Numerical Structure and Biodiversity of the Taxocenosis of Ephemeroptera in the South, North, and Central Regions of the Department of Antioquia, Colombia. | Ramírez Restrepo, John Jairo; Roldan Pérez, Gabriel Alfonso; Yepes, Gerardo |
| 2002 | Aplicación de algunos modelos de calidad de agua en dos sitios del embalse El Peñol - Guatapé (Antioquia - Colombia) | Aguirre Ramírez, Néstor Jaime; Palacio Baena, Jaime Alberto; Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2002 | Aspectos morfométricos y teóricos de un embalse tropical de alta Montana: represa La Fe, El Retiro, Colombia | Hernani, Alejandra; Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2014 | Biomasa de rotíferos de dos embalses con diferentes estados tróficos (Antioquia, Colombia) y su relación con algunas variables limnológicas | Villabona, Silvia Lucía; Ramírez Restrepo, John Jairo; Palacio Baena, Jaime Alberto; Buitrago Amariles, Robinson Ferley |
| 2016 | Biomasa del fitoplancton eucariota y su disponibilidad para la red trófica del embalse Riogrande II (Antioquia, Colombia) | Ramírez Restrepo, John Jairo; Palacio Baena, Jaime Alberto; Echenique, Ricardo O.; De Mattos Bicudo, Carlos E.; Parra García, Edison Andrés |
| 2000 | Cambios diurnos de variables físicas y químicas en la zona de ritral del río Medellín, Colombia | Urrego Montoya, Adriana Patricia; Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2004 | Caracterización del sedimento de una laguna tropical rasa | Ramírez Restrepo, John Jairo; Noreña, Juan |
| 2015 | Caracterización física y química del embalse Riogrande II (Antioquia), Colombia | Ramírez Restrepo, John Jairo; Díaz Cadavid, Abel; Mazo Blanco, David |
| 1998 | Caracterización limnológica preliminar de la ciénaga de Jotaudó (Chocó, Colombia) | Asprilla Murillo, Sonia; Ramírez Restrepo, John Jairo; Roldán Pérez, Gabriel Alfonso |
| 2007 | Características limnológicas del embalse el Peñol-Guatapé, Colombia | Aguirre Ramírez, Néstor Jaime; Palacio Baena, Jaime; Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2017 | Charophyta, Chlorophyta y Cryptophyta del embalse Riogrande II (Antioquia), Colombia | López Muñoz, Mónica Tatiana; De Mattos Bicudo, Carlos Eduardo; Echenique, Ricardo Omar; Ramírez Restrepo, John Jairo; Palacio Baena, Jaime Alberto |
| 2017 | Comparación morfológica y distribución geográfica de las especies Tabellaria fenestrata y Tabellaria flocculosa (Bacillariophyceae) en sistemas lóticos y lénticos de Colombia. | Medina Tombé, Mario Fernando; Sala, Silvia Estela; Vouilloud, Amelia Alejandra; Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2001 | Comportamiento de la tasa de sedimentación del material sestónico en dos periodos climáticos contrastantes en un lago urbano raso : Laguna del Parque Norte, Medellín (Colombia) | Ramírez Restrepo, John Jairo; Noreña Zapata, Juan Fernando |
| 2008 | Comunidad de peces en la ciénaga de Ayapel, Río Magdalena (Córdoba) Colombia : cambios espacio-temporales en su asociación | Ríos Pulgarín, María Isabel; Jiménez Segura, Luz Fernanda; Palacio Baena, Jaime Alberto; Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2008 | Diatoms from lentic and lotic systems in Antioquia, Chocó and Santander Departments in Colombia | Sala, Silvia; Ramírez Restrepo, John Jairo; Plata, Yasmín |
| 2000 | Dinámica de la comunidad zooplanctónica (excepto protozoa) en las zonas limnética y litoral de la Laguna del Parque Norte, Medellín (Colombia) | Sánchez, Jorge; Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2002 | Dinámica de la producción primaria fitoplanctónica en un sistema eutrófico tropical : laguna del Parque Norte, Medellín, Colombia | Ramírez Restrepo, John Jairo; Alcaráz Silva, Hernán Alonso |
| 1999 | Dinámica ecológica de Aphanizomenon Aphanizomenoides (cyanophyta, cyanophyceae) en un sistema eutrófico tropical | Ramírez Restrepo, John Jairo |
| 2004 | Dinámica temporal de la comunidad fitoplanctónica y variables físicas y químicas asociadas en el Lago Santander (Rionegro, Antioquia, Colombia) | Sierra Arango, Omaira Rosa; Ramírez Restrepo, John Jairo; Marín Vélez, Octavio Fernando |
| 2005 | Diurnal and spatial (vertical) dynamics of nutrients (N, P, Si) in four sampling days (summer, fall, winter, and spring) in a tropical shallow reservoir and their relationships with the phytoplankton community | Ramírez Restrepo, John Jairo; Bicudo, C. E. M. |
